El Programa plenamar pretén reforçar la sostenibilitat del sector pesquer i aqüícola espanyol, impulsant la col·laboració entre organitzacions i institucions públiques i privades que comparteixen l'objectiu de preservar els ecosistemes marins i les activitats sostenibles que en ells es desenvolupen.
A través d'aquestes subvencions es vol reconèixer projectes innovadors orientats a la protecció i recuperació de la biodiversitat marina, la recollida d'escombraries del mar, la millora del coneixement i la gestió de les zones marines protegides espanyoles , la reducció de les captures accessòries i l'aprofitament dels descarts, el suport a l'aqüicultura sostenible, l'assessorament en matèria ambiental, i el reforç de la col·laboració entre la comunitat científica i el sector pesquer, entre d'altres.
Des del Programa plenamar, es donaran suport a projectes que promoguin la sostenibilitat de les activitats pesqueres i aqüícoles a través de les següents temàtiques principals: